１）歯肉の状態の検査
歯肉の色調・腫れの程度、歯と歯肉の間の溝 （歯周ポケット） の深さ、出血の有無、歯石の有無、などを検査します。
２）歯の状態の検査
歯の本数や虫歯の有無、過去の治療の状況、歯の咬み合わせ、歯の動揺の程度、歯ぎしりがないか、などを検査します。
３）レントゲン（X線）写真による検査
必要によっては、レントゲン写真を撮影します。
レントゲン写真では、肉眼では見ることができない、歯を支える骨（歯槽骨）の状態を確認できます。
４）歯石の除去 （スケーリング）
歯石を、歯科の専門の器具で除去します。 歯周病が相当進行している場合は、部分的な麻酔をして、歯肉の溝の奥の歯石を丁寧に除去することもあります。
５）歯垢の除去と歯磨きの指導
磨き残しの食べ物残渣や歯垢などの歯の表面の汚れを染め出し、ブラッシング指導を行います。
また、汚れを丁寧に除去します（PMTC)。
６）治療終了
歯科医院での専門的なクリーニングと家での歯磨きの指導による歯周病の状態は落ち着き、歯ぐきは安定したとします。
しかし、歯周病は再発しやすい病気です。治療修了後も、症状により期間は異なりますが、一ヶ月～半年おきの定期的な検診をお勧めしています。
歯周病の治療は少しずつ治していくので、回数がかかります。
初期治療は約一か月の期間です。計算は、歯の本数によって異なります。（下表は全部の歯が残っていて、全体的に治療する場合です）
| 回数 | 処置 | 解説 | 点数（点） | 金額（円） |
| １日目 | 初診 | 歯周病の診察をします。 | 218 | |
| 歯周基本検査（Ⅰ） | 歯と歯肉の間の溝の深さや汚れ、出血、歯の動揺の度合いを調べます。 | 200 | ||
| X線写真撮影 | 口の中の全体の写真を撮ります。 | 317 | ||
| 歯科疾患管理 | ブラッシング指導、歯周病の状態の解説などをします。 | 130 | ||
| 歯石除去（上の歯） | 上の歯並びの歯石、歯垢を全般的に取ります。 | 64 + 38x2 | ||
| 計 | 1,005 | 3,020 | ||
| ２日目 | 再診 | 前回のクリーニングの予後を確認します。 | 42 | |
| 歯石除去（下の歯） | 下の歯並びの歯石、歯垢を全般的に取ります。 | 64 + 38x2 | ||
| 計 | 182 | 550 | ||
| ３日目 | 再診 | 前回のクリーニングの予後を確認します。 | 42 | |
| 歯周基本検査（Ⅱ） | どれだけ改善されたか、再度の検査をします。 | 200 | ||
| 根面清掃（上の前歯） | 歯と歯肉の間の溝の中の歯石などの汚れを、１本１本取り除きます。 | 58 x 6 | ||
| 計 | 566 | 1,700 | ||
| ４日目 | 再診 | 前回のクリーニングの予後を確認します。 | 42 | |
| 根面清掃（下の前歯） | 歯と歯肉の間の溝の中の歯石などの汚れを、１本１本取り除きます。 | 58 x 6 | ||
| 計 | 366 | 1,100 | ||
| ５日目 | 再診 | 前回のクリーニングの予後を確認します。 | 42 | |
| 根面清掃（小臼歯） | 歯と歯肉の間の溝の中の歯石などの汚れを、１本１本取り除きます。 | 62 x 8 | ||
| 計 | 538 | 1,610 | ||
| ６日目 | 再診 | 前回のクリーニングの予後を確認します。 | 42 | |
| 根面清掃（大臼歯） | 歯と歯肉の間の溝の中の歯石などの汚れを、１本１本取り除きます。 | 68 x 8 | ||
| 計 | 586 | 1,760 | ||
| ７日目 | 再診 | 前回のクリーニングの予後を確認します。 | 42 | |
| 基本検査（Ⅲ） | どれだけ改善されたか、再度の検査をします。 | 200 | ||
| 計 | 242 | 730 | ||
| （以降） | 歯周病が重篤の場合は、さらに歯周外科の手術を行います。 | |||
| 合計 | 3,485 | 10,470 |